1949年12月18日，人民解放军的隆隆炮声逼近成都，杨森和四川军阀孙震一同从成都市凤凰山机场乘飞机到海口，然后转飞台湾。1977年3月，杨森从菲律宾访问归来，被台北三军总医院检查为肺癌，两个月后，96岁的杨森咽下最后一口气，结束了漫长的一生。

杨森在49年随老将的溃兵逃往台湾，并客死他乡。他的后人又“杀”了回来，创建了著名的制药企业“西安杨森”。